在建于有马领地内的日本第一所西洋学校基督教学校中，被选拔出的精英们在外国教师的指导下接受拉丁语、古典、音乐等方面的教育。
看到日本学生用流畅的拉丁语发表、讨论的耶稣会准管区长吃惊地说“感觉自己简直就像住在科英布拉（葡萄牙）”
1579年来到日本的耶稣会视察员范礼安深感日本独自的风俗习惯成为传教的障碍，在日本传教之难。为此，提出了新的传教方针，不要将欧洲文化强加于日本，要在尊重日本独自文化的基础上开展传教活动。作为传教工作的重要一环，指示在有马和安土建立基督教学校（培养修道士的初等教育机构），由此在日本诞生了第一所西洋学校。
1580年创立于日野江城内的有马基督教学校由外国教师执掌教鞭，系统地教授拉丁文等语言、宗教、地理等文艺复兴时期的西洋学科。
日野江城遗迹和旧城区俯瞰图最初设立于日野江城内的基督教学校也受到了秀吉伴天连追放令（下令驱逐耶稣会传教士的禁教令）等的影响，被迫转移到有马领地内的八良尾。从传教的必要性上，八良尾很重视绘画、版画教育，教授了学生们非常高的绘画、版画技术。据说让学生们临摹从罗马带来的绘画，竟然达到了分不出哪个是真品的程度。
并且学生们还熟练掌握了拉丁文，用拉丁文进行论文发表、讨论。视察基督教学校的耶稣会准管区长对于学生们使用拉丁文的流畅程度，反复地说“感觉自己简直就像住在科英布拉（葡萄牙）”，吃惊于当时的学生们达到了可以用外语讨论的水平，那也理所当然，因为当时作为基督教学校教师的几乎所有传教士都是在欧洲大学获得了博士学位的优秀人才。
基督教学校第1批毕业生 伊东Mancio像（北村西望制作）最初从22名学生开始的基督教学校，在1595年学生数达到了70名，从八良尾迁到了有家。由于秀吉的禁教令还曾迁移到长崎，1601年再次迁回到有马。此时，有马晴信的夫人因病去世，当时位于京都的朝廷为了让有马迎娶新的夫人为他修建了新家，但晴信将新家捐赠给了耶稣会。
新家被用作基督教学校，在它的旁边还建造了被誉为“日本最庄严”的教会。当时，需要比日野江城更加坚固的城池，为此开始了原城的建设，但晴信曾一度中断原城的建设而优先教会的建设。这个传说告诉后人晴信是如何地重视基督教。
基督教学校的学生们也来来往往的城内大街（北有马町谷川商店街）在有马的领地内，有一段时间还设立了神学院（相当于现代大学，是培养神职人员的高等教育机关），为从各地集中而来的优秀青年成为神职人员而实施教育。但是，1612年基督教学校再次迁往长崎，1614年根据德川家康的禁教令而关闭了。自创立以来经过30多年，在这所基督教学校学习的学生们其后在禁教的日本，如文字所述，冒着生命危险进行基督教的传教工作。
对耶稣会来说，为了在日本创立基督教学校需要挑选保护基督教、保障传教士安全的领主地区。基督徒大名有马晴信的领地正符合了这个条件，1580年与安土一同在有马这片土地上建立了日本第一所基督教学校。
格列高利十三世传（1596年）中所描绘的有马和安土基督教学校想象图